SOS：T和B细胞受体的在线概率估计与生成
摘要：通过模拟VDJ重组和后续选择T和B细胞受体的最新进展，提供了有用的工具来分析和比较随时间、个体和组织变化的免疫库。一套名为IGoR [1]、OLGA [2]和SONIA [3]的工具已向社区公开发布，可根据高通量测序数据推断生成和选择模型。然而，使用这些工具需要一些脚本编程或命令行技能以及熟悉复杂数据集。因此，这些模型的应用尚未面向广大用户。在本应用注释中，我们通过介绍Simple OLGA & SONIA (SOS)，一个基于网络的界面，使无编程技能的用户能够计算其序列的生成和后选择概率，并生成批量的合成序列。该应用也可在手机上使用。
作者：Giulio Isacchini, Carlos Olivares, Armita Nourmohammad, Aleksandra M. Walczak, Thierry Mora
论文ID：2003.13149
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2020-11-20