使用无序比对方法对2019-nCoV进行的系统发育研究 （新型冠状病毒突变体的进化分叉）
摘要：SARS-CoV-2 (nCoV-19)病毒的系统发育树根据基因组序列的相似性进行了重建。 Betacoronavirus的树形拓扑结构与生物学家的系统学极为一致。由于树形构建包含了关于病毒突变的足够信息，因此适合研究人际传播的新型冠状病毒突变之间的进化关系。研究了14种主要突变株的出现，这些株可以分类为系统发育树的八个分叉。发现存在三种类型的病毒突变，即同一分支的亚分支间的突变，离根突变和树的大分支之间的根导向突变。从病毒突变与宿主选择的关系来看，我们发现免疫力较低的个体为病毒进化的积极自然选择提供了特殊环境。这为解释为什么nCoV-19系统发育树中两个远距离分支间通常发生大的突变提供了机制。这一发现有助于制定控制COVID-19传播的策略。
作者：Yang Gao, Tao Li, Liaofu Luo
论文ID：2003.01324
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2022-01-31