预测蛋白质中的原生接触：来自非平衡共进化过程的预测
摘要：蛋白质同源序列中残基的共进化分析是预测其原生构象的强大工具。共进化分析通常是在平衡Potts模型的框架下进行的，假设蛋白质已经在序列空间中演化了足够长的时间以达到热力学平衡。在这里，我们提出了一个基于蛋白质演化动力学明确描述的模型来描述序列之间的相关性。我们表明，这种方法相对于基于平衡模型的方法能够更准确地预测原生接触。
作者：D. Oriani, M. Cagiada, G. Tiana
论文ID：2002.03383
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2020-02-11