揭示生物分子构型及其相互作用的不同方法
摘要：在这篇论文中展示了一种克服通过超短UV激光脉冲照射来交联细胞（L-交联）的重要缺点的新技术。为了在高通量环境中将这种技术与染色体免疫沉淀（ChIP）相结合使用，需要实施一种快速的预筛选方法来建立适合的照射条件，以实现高效的L-交联，而无需进行最终和长时间的ChIP分析。在此报道了一种快速方法，首先将活体人细胞转染与编码雌激素受体α（ERα）和绿色荧光蛋白（ERα-GFP）的载体，使得细胞DNA的雌激素受体结构域（ERE）区域与ERα蛋白的已知互作关系可以通过研究照射细胞的荧光响应来检测。通过观察DNA完整性、蛋白稳定性和细胞存活情况来表征紫外线照射对细胞的损伤。还介绍了一种分析或重新审视DNA和RNA序列及其分子构型的新方法。该方法基于从Chern-Simons超重力导出的方法，用于描述DNA/RNA序列中的突变以及核酸之间的相互作用。作为初步案例，我们分析了KRAS人类基因序列及其一些突变。有趣的是，我们的模型显示了Chern-Simons流能够定量描述序列中的突变情况。
作者：Rosaria Benedetti, Francesco Bajardi, Salvatore Capozziello, Vincenzo Carafa, Mariarosaria Conte, Maria Rosaria Del Sorbo, Angela Nebbioso, Manjot Singh, Hendrik Gerard Stunnenberg, Mohammadhassan Valadan, Lucia Altucci, Carlo Altucci
论文ID：2002.02364
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2021-11-29