布尔网络中极限周期问题的复杂性

摘要:布尔网络是一种交互实体的通用模型,应用于基因调控等生物现象。吸引子发挥了核心作用,实体更新的时间表是事先未知的。本文介绍了与存在更新时间表相关的问题的计算复杂性的结果,这些时间表使得一些极限周期长度成为可能或不可能。我们首先证明,在并行更新的布尔网络中,判断是否存在长度为$k$的至少一个极限周期是$NP$-完全的。在块顺序更新时间表上添加存在量词不会改变问题的复杂性类别,但以下交替会使我们在多项式层次结构中上升一级:给定一个布尔网络,判断是否存在一个块顺序更新时间表,使其没有长度为$k$的极限周期是$Sigma\_2^P$-完全的。

作者:Florian Bridoux, Caroline Gaze-Maillot, K''evin Perrot, Sylvain Sen''e

论文ID:2001.07391

分类:Discrete Mathematics

分类简称:cs.DM

提交时间:2020-01-22

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