蛋白质的介电常数变异
摘要：使用一种新的半经验方法来计算分子极化率和Clausius Mossotti关系，我们计算了蛋白质数据银行（PDB）中所有结构的干燥蛋白质的静态介电常数。超过150,000个蛋白质的平均介电常数为3.23，标准偏差为0.04，与干燥蛋白质的先前测量结果相符。小的标准偏差是由于分子极化率与蛋白质体积之间的强相关性。我们注意到非氨基酸辅因子如叶绿素可能会显著改变介电环境。此外，我们的模型显示了介电常数在同一分子中根据组成的氨基酸和辅因子呈各向异性。最后，通过改变氨基酸质子化状态，我们表明pH的变化对蛋白质的介电常数没有显著影响。
作者：Muhamed Amin and Jochen K"upper
论文ID：2001.07053
分类：Biological Physics
分类简称：physics.bio-ph
提交时间：2020-05-14