关于使用REDCRAFT成功确定Pf2048.1结构的最低数据要求的调查
摘要：用于NMR光谱蛋白质结构揭示的传统方法依赖于距离限制，也被称为核Overhauser效应 (NOEs)。使用NOEs作为NMR光谱结构确定的主要来源耗时且昂贵。残余偶极耦合 (RDCs)已成为NMR光谱结构计算的替代方法。本研究报告了使用RDC数据计算新型蛋白质PF2048.1的结构的结果，并确定了使用软件包REDCRAFT进行成功结构计算的最低数据要求。我们的研究从使用两种定向介质中四组合成RDC数据开始，并通过将RDC数据减小到{CN, NH}和{NH}分别来达到最终极限。我们的结果表明，只需使用{CN, NH}和{NH}数据，即可将该蛋白质的结构揭示到目标结构的0.533AA范围内。
作者：Casey A. Cole, Daniela Ishimaru, Mirko Hennig, Homayoun Valafar
论文ID：2001.03088
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2020-01-10