解析可遗传信息的框架
摘要：生物系统通过复制基因序列和环绕基因序列组装的循环调节因子传递可遗传信息。在这里，我开发了一个包括循环调节因子的遗传和发育框架，通过定义实体、传感器和感知属性来解析有机体对自身和环境的感知能力。实体包括小分子（ATP、离子、代谢产物等）、大分子（单个蛋白质、RNA、多糖等）和分子组装体。尽管浓度可能是传感器测量小分子时唯一相关的属性，但对于大分子和组装体，传感器可以测量包括浓度、序列、构象和修饰等多个属性。在给定环境中，每一代中重新创建的这些实体和传感器的配置都可以指定大量的信息，驱动每一代中复杂的发育过程。这个实体-传感器-属性框架解释了传感器如何限制可区分状态的数量，不同的分子构型如何在功能上等效，以及传感器调控如何防止检测某些扰动。总体而言，这个框架对于理解生命进化、信息存储如何随复杂性而演化以及生命起源之前的演化过程具有指导作用。
作者：Antony M Jose
论文ID：1912.09001
分类：Other Quantitative Biology
分类简称：q-bio.OT
提交时间：2020-03-03