DomainScope：基于蛋白质结构域连接的疾病网络
摘要：蛋白质结构域是蛋白质的高度保守的功能单元。由于它们携带功能重要的信息，大多数编码疾病变异位点位于结构域上。此外，结构域是可以用于药物传递目的的特定蛋白质单元。在本研究中，利用与疾病相关的变异位点信息，基于它们共享相同结构域和结构域变异位点，构建了一个疾病网络。结果共有49,990个由结构域变异位点相连的疾病对，以及533,687个共享相同突变结构域的疾病对。将这些疾病对与使用先前方法（如基因识别和基因变异位点识别）生成的疾病对进行比较，发现超过8,000个疾病对不仅在基因配对中缺失，而且在文献中也没有常见地共同出现。通过对疾病主题类别进行分析，发现基于结构域的疾病网络与基于基因的疾病网络相比，在疾病类别之间有更多的连接而不仅仅是在同一疾病类别内。此外，通过使用结构域创建的疾病网络进行药物再利用的研究发现，16,902对疾病中有一种疾病有报告的药物，而另一种疾病没有，凸显了这种新方法的药物再利用潜力。
作者：Alin Voskanian-Kordi, Ashley Funai, Maricel G. Kann
论文ID：1911.08676
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2019-11-21