马来西亚柔佛州新山市初中学生室内微生物群落、环境特征与哮喘
摘要：热带地区室内微生物多样性和组成被认为会影响哮喘的流行率和严重程度。本研究收集了马来西亚柔佛州新山市21个初中教室的地板灰尘样品和环境特征，以及309名学生与哮喘症状相关的健康数据。利用16s rRNA基因和ITS区域测序来表征细菌和真菌的组成，通过qPCR定量测定细菌和真菌的绝对浓度。共鉴定了326个细菌属和255个真菌属。其中，5个细菌（Sphingobium，Rhodomicrobium，Shimwellia，Solirubrobacter，Pleurocapsa）和2个真菌（Torulaspora和Leptosphaeriaceae）的分类群有保护哮喘严重程度的作用。两个细菌分类群Izhakiella和Robinsoniella与哮喘严重程度呈正相关。一些保护性细菌分类群，如Rhodomicrobium，Shimwellia和Sphingobium在先前的研究中被报道为保护菌，而其他分类群则是首次报道。环境特征，如建筑年龄，每个房间体积的纺织帘子尺寸，蟑螂的出现，居住者从家中带来的尘螨过敏原浓度等，参与塑造整体微生物群落，但与哮喘相关的分类群没有关联。而明显的潮湿和霉变，虽然不会改变地板灰尘的整体微生物群落，但会降低保护性细菌Rhodomicrobium的浓度（η=-2.86，p=0.021），提示微生物、环境特征和哮喘症状之间存在复杂的相互作用。总的来说，这是第一项在热带地区表征与哮喘相关的微生物群落和其环境因素的室内微生物研究，促进了对该地区微生物暴露和呼吸健康的理解。
作者：Xi Fu, Dan Norback, Qianqian Yuan, Yanling Li, Xunhua Zhu, Yiqun Deng, Jamal Hisham Hashim, Zailina Hashim, Yi-Wu Zheng, Xu-Xin Lai, Michael Dho Spangfort, Yu Sun
论文ID：1911.06946
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2020-03-24