两种脱溶电位的故事：高静压下蛋白质行为的调查
摘要：两种不同的气压依赖势能用于蛋白质的粗粒度分子模拟研究蛋白质的折叠和展开过程。虽然这两种势能都包括将直接接触井和溶剂介导接触井分离的脱溶障碍，但关于这些特征如何随着气压变化而变化还存在争议。我们对基于结构的蛋白质模型中脱溶势能在两种不同气压依赖性情况下进行了研究，并将其与基于实验证据对真实蛋白质行为的已知情况进行了比较。我们发现蛋白质在压力-温度相图上的折叠转变曲线取决于势能井的最小值和压力之间的关系。对于在压力下减少总体积的蛋白质来说，势能的特征是直接接触井在高压下比水介导接触井不稳定更重要。我们还对基于结构的精简模型在理解蛋白质在广泛的相空间中的现象行为方面的实用性和重要性进行了讨论。
作者：Andrei G. Gasic and Margaret S. Cheung
论文ID：1911.06692
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2020-11-17