空间DNA甲基化模型的随机自动机网络描述
摘要：DNA甲基化是调控基因表达和控制细胞发展的重要生物学机制。机械建模已成为提高我们对甲基化模式形成动力学的理解的常用方法。最近的研究发现胞嘧啶碱基的甲基化状态可以受其DNA邻域的影响。因此，有必要将只考虑一个胞嘧啶和其对应的DNA链上伴侣（CpG）的现有数学模型进行推广，以包括这种邻域依赖性。一种方法是将该系统描述为具有功能转换的随机自动机网络（SAN）。我们展示了通过使用SAN描述将单个CpG模型成功推广为多个CpG，并通过与大量蒙特卡洛模拟结果进行比较来验证结果。
作者：Alexander L"uck, Verena Wolf
论文ID：1910.10968
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2019-10-25