AFDP：一种自动化功能描述预测方法，用于提高蛋白质功能预测的准确性。
摘要：开发自动方法来注释未知基因和蛋白质的功能已经变得至关重要，这是由于高通量生物测序技术和产生的组学数据量的快速增长。已经开发了一些工具，如AHRD，可以将已知蛋白质的特征应用于未知蛋白质的注释。其他一些算法，如eggNOG，应用同源蛋白质群来检测最可能的功能。然而，虽然现有的工具专注于检测最相似的特征，但它们不能在保持准确性的同时泛化和整合来自多个同源物的信息。在这里，我们设计了一种融合了AHRD和eggNOG两个现有工具的集成方法，称为AFDP，用于蛋白质功能预测，通过应用我们的stCFExt算法生成更精确的人类可读描述。stCFExt使用swiss-prot中可用的手工编目描述来创建功能描述。使用基准数据集，我们表明我们的方法预测的注释比eggNOG和AHRD的注释更准确。
作者：Samaneh Jozashoori, Amir Jozashoori, Heiko Schoof
论文ID：1910.06965
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2019-10-17