组织基因组工程的吉盖拜茨尺度
摘要：工程化生物体的整个基因组能够对组织、功能和外部相互作用进行大规模改变，对工业、医学和环境产生重大影响。DNA合成和生物体工程的改进已经让拥有百万碱基对基因组的细菌（如大肠杆菌）和酵母菌（如酿酒酵母）发生了实质性改变。同时，基因组规模建模的最新进展也越来越多地为代谢网络设计提供了指导。然而，将这些和其他相关技术整合到适用于千兆碱基对基因组工程的工作流程中仍然面临着重大挑战。 特别是，我们发现协调模型、设计、构建和测量数据在大规模团队和复杂技术系统之间的流动是一个被低估的重大挑战，而这些挑战可能需要使用千兆碱基对基因组工程。我们建议社区通过以下方式来解决这些挑战：1）采用和扩展现有标准和技术，以在千兆碱基对基因组水平上表示和交换信息；2）开发新技术来解决围绕数据整理和质量控制的重大问题；3）进行基础研究，探索在基因组尺度上进行建模和设计的整合方式；4）开发新的法律和合同基础设施，更好地促进多个机构之间的协作。
作者：Bryan A. Bartley, Jacob Beal, Jonathan R. Karr, Elizabeth A. Strychalski
论文ID：1909.01468
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2020-03-25