使用UnityMol-APBS在虚拟现实中可视化生物分子的电荷状态
摘要：利用虚拟现实技术来可视化和分析小有机分子、分子无机复合物以及生物分子系统（如氧化还原蛋白质和酶）之间的相互作用。一个在生物医学领域常用的工具是APBS软件，该软件用于求解大型生物分子组装的连续电荷动力学方程。在生物医学领域中，使用APBS进行蛋白质配体相互作用的分析具有广泛的应用。目前，APBS的典型使用方式是通过命令行完成，然后使用各种二维外部分子可视化软件进行可视化。然而，这个过程存在一定的局限性：使用二维界面可视化三维对象会掩盖了深度信息。在这里，我们开发了一个名为UnityMol-APBS的单一应用程序，该程序提供了一个双重体验，用户可以在标准桌面或沉浸式虚拟现实环境中使用全套APBS工具，而无需使用命令行界面。
作者：Joseph Laureanti, Juan Brandi, Elvis Offor, David Engel, Robert Rallo, Bojana Ginovska, Xavier Martinez, Marc Baaden, Nathan A. Baker
论文ID：1908.11261
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2019-11-14