使用神经网络预测物种间基因表达

摘要:基于实验数据,我们训练了一个神经网络来预测大鼠细胞基因表达水平。神经网络使用开放TG-GATES数据库中的人鼠样本进行训练,这些样本是经过相同剂量的相同化合物处理的。在对一组保留了化合物的测试集进行评估时,该网络成功地预测了人的表达水平。在大多数测试化合物中,根据预测的表达水平确定的差异表达基因列表与根据实际人类实验数据确定的差异表达基因列表非常吻合。

作者:Peter Eastman and Vijay S. Pande

论文ID:1907.03041

分类:Genomics

分类简称:q-bio.GN

提交时间:2019-07-09

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