基于RNA-Seq数据的CHO细胞差异基因表达的生物信息学流程
摘要：中国仓鼠和中国仓鼠卵巢（CHO）细胞系的基因组序列的出版最近几年以前所未有的分辨率促进了对这些生物制药细胞工厂的研究。特别是通过将下一代测序（NGS）技术应用于转录组RNA表达（RNA-Seq）的特点，我们对CHO细胞转录组的理解迅速提升。在本章中，我们提供了一个计算流水线，用于从Illumina平台分析CHO细胞RNA-Seq数据以确定差异表达的基因。运行此分析所需的示例数据和生物信息学工作流在www.cgcdb.org/rnaseq_analysis_protocol.html免费提供。
作者：Craig Monger, Krishna Motheramgari, John McSharry, Niall Barron and Colin Clarke
论文ID：1905.00204
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2019-05-02