拥挤诱导的尿素展开无配体蓝铜蛋白的延长构象：在硅胶中模拟研究拥挤剂形状的作用
摘要：使用核磁共振的溶液测量方法，我们发现当存在合成拥挤剂二聚体20时，尿脲未折叠的蛋白质apoazurin会变得更长，与基于体积排斥的大分子拥挤效应预测相反。为了探索体积排斥之外的复杂相互作用，我们采用粗粒度分子动力学模拟探索在化学变性条件下单分散拥挤剂盒中apoazurin的构象集合。未折叠apoazurin的延长构象似乎是由蛋白质和拥挤剂之间的有效吸引力和拥挤剂的形状相互作用所导致的。使用保体积拥挤剂模型，我们展示了拥挤剂的形状提供了耗尽力的各向异性方向，在这个方向上，周围一束杆状拥挤剂稳定了存在蛋白质和拥挤剂之间有效吸引力的未折叠apoazurin的延长构象。
作者：Fabio C. Zegarra, Dirar Homouz, Andrei G. Gasic, Lucas Babel, Michael Kovermann, Pernilla Wittung-Stafshede, Margaret S. Cheung
论文ID：1904.04707
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2020-11-17