侧抑制的布尔分析

摘要:对高度保守的Delta-Notch系统进行了简单的空间模型布尔网络的研究。模型假设在每个细胞中,Notch通过同样的细胞抑制Delta的作用,在周围细胞中,Delta能够刺激Notch的活化。我们考虑表示细胞之间邻居关系的无向图上的完全异步动力学。在这个框架中,可以证明所有吸引子都是系统的定点,与邻居关系无关,例如,通过使用已知的简化版本模型的已知性质,其中每个细胞只定义了一种物种。这些定点对应于离散和连续的侧向抑制建模中出现的所谓的细粒度“模式”。我们研究了定点的可达性,并给出了全模型和简化模型的陷阱空间和吸引域的表征。此外,我们使用陷阱空间的表征来研究模式对扰动的稳定性。这种定性分析的结果可以补充和指导基于模拟的方法,并为更复杂机制的研究提供基础。

作者:Elisa Tonello and Heike Siebert

论文ID:1904.02544

分类:Discrete Mathematics

分类简称:cs.DM

提交时间:2020-07-31

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