BpForms和BcForms：描述非规范聚合物和复合物以促进全面生化网络的工具
摘要：非规范残基、帽子、交叉连接和切口在许多DNA、RNA、蛋白质和复合物的功能中扮演着重要角色，但我们对非规范大分子网络如何产生行为仍不完全理解。一个障碍是我们对抽象描述大分子的有限格式（如IUPAC）的理解。为了克服这个障碍，我们开发了BpForms和BcForms，这是一个包含本体论、语法和软件的工具包，用于将聚合物和复合物的主要结构抽象为残基、帽子、交叉连接和切口的组合。这个工具包可以帮助质量控制、交换和整合关于大分子主要结构的信息，进而构建精细化的细胞内生物化学全局网络。
作者：Paul F. Lang, Yassmine Chebaro, Xiaoyue Zheng, John A. P. Sekar, Bilal Shaikh, Darren A. Natale and Jonathan R. Karr
论文ID：1903.10042
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2021-06-04