PBBFMM3D:一种用于核矩阵向量乘法的并行黑盒算法

摘要:使用核矩阵向量乘积在许多科学和工程应用中无处不在。然而,朴素方法需要$O(N^2)$的操作,对于大规模问题来说是难以接受的。我们引入了一种并行方法,证明需要$O(N)$的操作来降低计算成本。我们的方法的独特特点是只需要能够评估核函数,为用户提供了一个黑盒接口。我们的并行方法针对多核共享内存机器,并使用OpenMP实现。数值结果表明,在32个核上可实现高达19倍的加速。我们还提出了地质统计的一个实际应用,其中我们的并行方法被用于快速计算协方差矩阵的主成分分析。

作者:Ruoxi Wang, Chao Chen, Jonghyun Lee, Eric Darve

论文ID:1903.02153

分类:Mathematical Software

分类简称:cs.MS

提交时间:2021-04-30

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