细菌免疫库的规模

摘要:细菌和古菌中一些具有基于CRISPR-Cas机制的免疫系统,该系统赋予它们对噬菌体的适应性免疫能力。在这些物种中,细菌个体通过保存一组被称为spacer的病毒DNA元素来记忆过去的感染。典型的spacer组合包含几十个spacer。鉴于细菌可以拥有非常大的基因组,并且拥有更多的spacer应该提供更好的记忆能力,因此细菌为何只分配这么少的遗传空间给他们的适应性免疫系统是一个困惑。在这里,我们确定了细菌免疫库大小与对特定威胁的响应效果之间的基本权衡,并展示了这种权衡对CRISPR组合优化大小的限制。

作者:Serena Bradde, Armita Nourmohammad, Sidhartha Goyal, Vijay Balasubramanian

论文ID:1903.00504

分类:Populations and Evolution

分类简称:q-bio.PE

提交时间:2022-06-08

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