利用对称性阐明蛋白质动力学和协同作用中全局形状和局部相互作用的角色
摘要：全球生物分子组装的运动模式在直觉上被认为形状起着决定性的作用。然而，目前尚不清楚形状如何准确地决定运动模式。结构内部保持某种形状的局部相互作用有什么作用？全球形状和局部相互作用的贡献通常混合在一起，很难分辨出来。在这项研究中，我们利用对称性来阐明全球形状和局部相互作用在蛋白质动力学中的不同作用。对称复合物提供了一个理想平台，因为在这些复合物中，局部相互作用和全球形状的效应是可以分开的，允许鉴定其不同的作用。我们基于对称组装的关键发现是：（i）每个亚单位的运动模式主要由亚单位内部相互作用（IRSi）决定，其次是亚单位间相互作用（IESi）；（ii）整个组装的运动模式完全由全球对称性/形状决定，与局部相互作用（iESi或IRSi）无关。然后讨论了这些发现如何推广到任何形状的复合物，无论是否具有对称性。
作者：Guang Song
论文ID：1902.03526
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2019-02-12