用DNA-BRNN鉴定着丝粒卫星
摘要：人类α卫星和卫星2/3占人类基因组的几个百分点。然而，用传统算法识别这些序列需要大量的计算。在这里，我们开发了dna-brnn，一个递归神经网络，用来学习这两类着丝粒重复序列。它与RepeatMasker具有高度相似性，并且速度更快。Dna-brnn探索了深度学习的新应用，可能加速了对这两类重复序列进化的研究。 可用性和实现方式：https://github.com/lh3/dna-nn 联系人：[email protected]
作者：Heng Li
论文ID：1901.07327
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2019-03-19