蛋白质的物理折叠编码
摘要：蛋白质折叠问题长期以来一直是分子生物学中的一个挑战。本研究使用分子动力学模拟揭示了在水溶液环境中蛋白质因静电吸引力而可重复折叠的方式，即通过平行分布的相邻平面肽基团来实现。我们发现蛋白质的超快速折叠是由氢键形成的贡献推动的。温度引起的扭转波沿着未折叠的蛋白质传播，打破了特定氨基酸的平行分布状态，暗示折叠的开始。相邻侧链之间的电荷和旋转阻力差异用于解读蛋白质精确次级结构发展的物理折叠规律。我们提出了一种解码氨基酸序列以预测蛋白质天然结构的强大方法。该方法通过与文献中的实验结果进行比较进行验证。
作者：Xiaoliang Ma, Chengyu Hou, Liping Shi, Long Li, Jiacheng Li, Lin Ye, Lin Yang, Xiaodong He
论文ID：1901.00991
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2019-01-11