蛋白质局部表面形状比较的三维Krawtchouk描述符
摘要:三维物体的直接比较是计算成本较高的,因为需要对物体进行平移、旋转和缩放以评估它们的相似性。在三维物体比较的应用中,通常特别关注识别物体的特定局部区域。我们最近基于离散正交Krawtchouk多项式开发了一组基于二维矩不变量的方法,用于比较局部图像块。在本研究中,我们将它们扩展到三维,并构建了具有平移、旋转和缩放不变性的三维Krawtchouk描述符(3DKD)。新的描述符能够从任何感兴趣的区域提取三维表面的局部特征。这个属性使得可以比较来自不同三维物体的两个任意局部表面区域。我们介绍了3DKD的新形式,并将其应用于蛋白质表面的局部形状比较,以预测与查询蛋白质结合的配体分子。
作者:Atilla Sit and Daisuke Kihara
论文ID:1812.10841
分类:Biomolecules
分类简称:q-bio.BM
提交时间:2018-12-31