扩展线性噪声逼近到受内在噪声和缓慢对数正态分布外部噪声影响的生物化学系统
摘要：细胞内生化网络的动力学是随机的知名度很高。这是由于内在噪声产生于网络中生化反应的随机时机，以及外在噪声产生于未知分子组分与网络的相互作用和细胞的变化环境。虽然有很多方法研究内在噪声对系统动力学的影响，但对于同时考虑两种噪声类型的影响方法很少。在这里，我们展示了如何扩展传统的线性噪声近似方法，以允许快速评估受内在噪声和缓慢的对数正态分布外在噪声影响的生化网络的分子数统计。该理论应用于基因调控网络的简单模型，并通过与精确的随机模拟进行比较来验证其有效性。特别地，我们展示了外在噪声如何改变分子数波动方差与速率常数的依赖关系，输入和输出信号分子之间的互信息，以及前馈环路结构的鲁棒性。
作者：Emma M. Keizer, Bjorn Bastian, Robert W. Smith, Ramon Grima and Christian Fleck
论文ID：1811.05649
分类：Subcellular Processes
分类简称：q-bio.SC
提交时间：2019-06-05