爆炸暴露对基因间相互作用的影响
摘要：低水平爆炸的重复暴露可能引发一系列不良健康问题，如创伤性脑损伤（TBI）。尽管许多研究成功地确定了与TBI相关的基因，但TBI的细胞机制尚未完全阐明。在本研究中，我们利用RNA-seq数据构建转录组贝叶斯网络，研究基因之间的潜在关系。我们收集了军事训练计划中的33个个体的爆炸前后转录本数据，并结合我们的系统方法，提供了研究爆炸波暴露对基因-基因相互作用影响的独特机会。通过挖掘网络，我们确定了与免疫系统和炎症过程相关的四个子网络，由于暴露而被破坏。在转录本表达水平中具有相对较高折变的基因中，ATP6V1G1、B2M、BCL2A1、PELI、S100A8、TRIM58和ZNF654对基因-基因相互作用的失调产生了重大影响。本研究揭示了重复暴露于创伤条件如何增加转录本表达水平的折变，并假设了进一步实验研究的新目标。
作者：Akram Yazdani
论文ID：1809.05095
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2018-11-13