尼古丁乙酰胆碱受体的边界脂质：通过粗粒化分子动力学模拟的自发分配
摘要：重组的尼古丁乙酰胆碱受体（nAChRs）在添加胆固醇到重组混合物中时表现出显著的增益功能，并且胆固醇影响nAChRs在结构形成的膜内的组织方式，但nAChR是分配到富含胆固醇的液态有序（“脂座”或l_o）区域还是贫含胆固醇的液态无序（l_do）区域是未知的。我们使用粗粒度分子动力学模拟观察胆固醇、饱和脂质和多不饱和脂质与nAChRs之间的自发相互作用。在二元二棕榈酰磷脂胆碱：胆固醇（DPPC：CHOL）混合物中，胆固醇和DPPC脂基被观察到自发进入nAChR TMD中的“非环状”深腔，尤其是在亚基界面和Β亚基中心，通过在原生膜中nAChR的冷冻电镜结构中的低氨基酸密度来促进。胆固醇在TMD周围形成了丰富的环带，但这种效应最多延伸到5-10埃。在包含PUFAs的结构形成三元混合物中，单个受体的存在并不明显影响区域形成的可能性。nAChR分配到出现的任何贫含胆固醇的l_do区域，无论l_do或l_o区域脂质具有PC或PE头基。边界脂质中PUFAs的富集与它们从富含胆固醇的相中分离的倾向呈正相关。长的n-3链（在这里用DHA进行测试）在环状和非环状嵌入位点中丰富，部分取代了胆固醇和完全取代了DPPC，并且在束内部位点甚至更深的位置。较短的n-6链在从非环状位点取代胆固醇方面效果要差得多。
作者：Liam Sharp, Reza Salari, Grace Brannigan
论文ID：1807.11090
分类：Subcellular Processes
分类简称：q-bio.SC
提交时间：2018-12-04