αβ T细胞受体的起源
摘要：通过由称为$alpha$和$beta$的两个链组成的受体的多样性来识别病原体，T细胞（TCR）配库依赖于多样性。使用高通量测序和计算链-配对实验的人类TCR配库结果，我们定量表征了$alpha$和$beta$的生成过程。我们估计了在第一染色体上失败或成功后，在第二染色体上$beta$链的救援重组概率。与$beta$链不同，$alpha$链在两个染色体上同时重组，从而导致我们使用机械模型预测的两个基因的相关统计数据。我们发现大约28%的细胞同时表达两条$alpha$链。我们报告了共享相同$beta$链但不同$alpha$链的克隆过度表达，表明它们对常见的免疫挑战有响应。总而言之，我们的统计分析提供了一个完整的定量机制图像，解释了生成过程中观察到的相关性。我们了解到生成任何TCR$alphaeta$的概率低于$10^{-12}$，并且估计了$alphaeta$TCR配库的生成多样性和共享特性。
作者：Thomas Dupic, Quentin Marcou, Aleksandra M. Walczak, Thierry Mora
论文ID：1806.11030
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2019-05-14