遗传学的范畴论 II:基因型、表型和单倍体型
摘要:用于建模群体单倍体群的幂等交换幺半群类别的词汇问题。更具体地说,我们设计了一个代数框架,可以通过幂等交换幺半群中的单倍体的代数方程来解开人口分层关系并推断连锁失衡。我们展示了如何通过考虑中间表型和遗传机制(如分离和同源重组)来澄清单倍体-表型关联关系。这项工作为组合GWAS在复杂性状研究中的实施铺平了道路,并为推断遗传变异与相应的调控回路的相互作用提供了一个框架。在整个论文中,我们将基因型、单倍型和单倍群的概念形式化,并在pedigrads的语言中对分离和同源重组进行建模(在之前的工作中引入)。使用pedigrads的好处是它们提供了一个计算框架,可以推导出几代的单倍型动态。
作者:R''emy Tuy''eras
论文ID:1805.07004
分类:Category Theory
分类简称:math.CT
提交时间:2023-03-09