学生驱动的社区基因组注释的快速指南
摘要：扩展目标生物体可用的分子和遗传工具需要高质量的基因模型，但这些模型仅适用于经过多年大量修饰和实验验证的少数几个模式生物体。如今，生物数据库中的大多数基因模型是通过使用自动注释流水线在草稿基因组组装中识别出来的，这些流水线通常基于来自远缘相关的模式生物体的同源基因。手动修饰费时且往往需要大量专业知识，但它在改善基因模型结构和识别方面起着重要作用。手动注释对于小型研究群体来说可能是一项艰巨且成本高昂的任务，但将本科生纳入社区基因组注释联盟中对教育和改进基因组资源可能是相互有利的。我们概述了由主要由本科生注释者组成的高效手动注释工作流程。该模型可以扩展到大型团队，并通过增量评估包括质量控制过程。此外，它为学生提供了增加对基因组生物学的理解以及与同侪和高级研究人员在多个机构合作参与科学研究的机会。
作者：Prashant S. Hosmani, Teresa Shippy, Sherry Miller, Joshua B. Benoit, Monica Munoz-Torres, Mirella Flores, Lukas A. Mueller, Helen Wiersma-Koch, Tom D'elia, Susan J. Brown and Surya Saha
论文ID：1805.03602
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2019-06-19