VIOLA - 一种多功能的基于网络的神经网络模拟输出可视化工具。
摘要：视觉化神经网络模型和相应的计算机模拟是解释皮质组织中神经元特性、连接性和测量活动关系的宝贵工具。通过实验观察到的沿皮质表面传播的时空活动模式，可以用具有分层几何结构和距离依赖性连接的神经网络模型来描述。对于由多模式和多维度的模拟数据产生的结果的解释需要将交互式可视化步骤整合到现有的模拟分析工作流程中。在这里，我们提出了一组名为视图的交互式可视化概念，用于在拓扑网络模型中对活动数据进行视觉分析，以及相应的参考实现VIOLA（层活动的可视化）。该软件是一个轻量级的、开源的、基于Web的、平台无关的应用程序，结合和调整了现代交互式可视化范例，如协同多视图，用于大规模并行神经生理数据。作为一个应用案例演示，我们考虑了受到外部群体空间约束刺激的两个种群、分层点神经元网络模型的尖峰活动数据。通过多个协调的视图，可以在详细的定量数据分析之前对神经活动的时空特征进行探索性和定性的评估。此外，欧洲人脑计划等相关工作力求提供集成模型开发、模拟、分析和溯源跟踪的在线用户门户，在其中交互式可视化分析工具是一个组成部分。因此，需要基于浏览器兼容的、基于Web技术的解决方案。在这个范围内，通过VIOLA我们提供了一个第一版的原型。
作者：Johanna Senk, Corto Carde, Espen Hagen, Torsten W. Kuhlen, Markus Diesmann, Benjamin Weyers
论文ID：1803.10205
分类：Neurons and Cognition
分类简称：q-bio.NC
提交时间：2022-09-16