落叶松全转录组中三联体组成与组织来源之间的初步结果
摘要:西伯利亚落叶松转录组的结构集合性进行了研究。使用$K$-means技术识别了64维空间中的聚类,被聚类的对象是基因组的不同片段。发现了这些片段分布中类似四面体的结构。对每个类别和类别之间的Chargaff不相容性进行了测量,揭示了类别之间的相对相似性。将结果与每个组织的特定转录组的结果进行了比较。还开发了一个包含为特定组织组装的contigs的替代转录组,将后者与真实的总转录组进行了比较,观察到了显著差异。
作者:Michael Sadovsky, Tatiana Guseva, Vladislav Birukov, Tatiana Shpagina, Victoria Fedotovskaya
论文ID:1803.03461
分类:Other Quantitative Biology
分类简称:q-bio.OT
提交时间:2018-03-12