T细胞受体广泛的交叉反应实现了特异性且足够快速的目标搜索
摘要：免疫系统如何组织有限但有效的受体库？ 通过免疫系统中固有的受体库，该有限的受体库必然具有对多种病原体的交叉反应性，同时对不同的病原体具有高度特异性。在本研究中，我们通过计算的方法，基于它们的氨基酸序列的配对结合能，对T细胞受体和源自感染性疾病的肽段的交叉反应性进行了研究。我们发现T细胞受体具有多样的氨基酸组成，从而导致肽段结合的广泛的交叉反应性。高/低交叉反应性的T细胞受体具有更多/较少相互作用氨基酸。接着，我们研究了自然T细胞库的目标搜索时间，并比较了高交叉反应性和低交叉反应性T细胞库之间的目标搜索时间。根据我们的计算结果，自然T细胞库在寻找特定目标时具有特异性且足够快速。高交叉反应性和非特异性的T细胞需要更多时间从错误的目标上脱离，而低交叉反应性T细胞受体需要更多时间来寻找正确的目标。基于分子序列和它们的配对结合能的计算平台，可以在进一步探索免疫认知方面发挥作用。
作者：Jin Xu and Junghyo Jo
论文ID：1712.04633
分类：Cell Behavior
分类简称：q-bio.CB
提交时间：2017-12-14