ABCpy：基于高性能计算的近似贝叶斯计算视角
摘要：ABCpy：一种高度模块化的近似贝叶斯计算（ABC）科学库，使用Python编写。本文的主要贡献是记录了一种软件工程方法，使领域科学家能够轻松将ABC应用于他们的研究中，而不必成为ABC专家；使用ABCpy，他们可以轻松地运行大规模并行模拟，不需要太多关于并行化的知识。此外，ABCpy使ABC专家能够轻松开发新的推断方案，并在标准化环境中评估这些方案，并扩展库以添加新的算法。这些优点主要来自ABCpy的模块化。我们概述了ABCpy的设计，并提供了一个重点关注并行化的性能评估。这使我们意识到一些ABC算法中的固有不平衡问题。我们开发了一种动态调度的MPI实现来减轻这个问题，并根据它们对高性能计算的适应性评估了各种ABC算法。
作者：Ritabrata Dutta and Marcel Schoengens and Lorenzo Pacchiardi and Avinash Ummadisingu and Nicole Widmer and Pierre K"unzli and Jukka-Pekka Onnela and Antonietta Mira
论文ID：1711.04694
分类：Computation
分类简称：stat.CO
提交时间：2021-12-20