用虚拟裸手触摸蛋白质:如何在虚拟现实中可视化蛋白质药物复合物及其动态

摘要:在预测更有效的下一代药物之前,精确可视化药物与其蛋白质靶点之间的原子几何相互作用在结构模型中的能力至关重要。目前,在尝试上述操作时,医药化学家通常使用二维投影来获取三维结构中的信息,这可能会阻止有用特征的展示。通过实现沉浸式虚拟现实(VR),可以实现对模型中原子几何的三维配置的更精确的可视化。在本研究中,我们提出了一个可免费使用的软件管道,用于通过VR可视化蛋白质结构。本研究中使用的新型客户硬件,如HTC Vive和Oculus Rift,价格合理。此外,我们还将VR可视化与快速算法相结合,以模拟蛋白质柔性的分子内运动,进一步改进了通过暴露在不太信息丰富的静态模型中可能隐藏的分子相互作用的结构导向药物设计。

作者:Erick Martins Ratamero, Dom Bellini, Christopher G. Dowson, Rudolf A. Roemer

论文ID:1710.03655

分类:Biomolecules

分类简称:q-bio.BM

提交时间:2018-08-14

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