粗粒度分子动力学模拟纤维蛋白聚合
摘要：深静脉血栓和糖尿病患者往往具有高凝血性血浆，从而增加了血栓破裂形成血栓栓塞的可能性，可能导致中风和死亡。尽管血栓形成和溶解研究领域取得了进步，但对血小板贫乏血浆中机械性质的变化及其对血栓栓塞形成的影响仍知之甚少。在本文中，我们提出了一种新的计算方法，利用分子模拟模拟纤维蛋白凝块的形成。通过有效地组合反应分子动力学概念和粗粒化原理，我们利用了反应粗粒化分子动力学来预测纤维蛋白凝块的复杂网络形成和纤维分支。重量为340千道尔顿的纤维蛋白原被转化为一个由9个珠子组成的简单弹簧粗粒系统，并使用我们定制的反应势，模拟了纤维蛋白凝块的形成。因此，形成的纤维蛋白凝块在定性上与实验结果一致，据我们所知，这是第一种可以改善我们对血栓形成及其与机械性质之间关系理解的纤维蛋白凝块的分子聚合研究。
作者：Sumith Yesudasan and Rodney D. Averett
论文ID：1710.00123
分类：Biological Physics
分类简称：physics.bio-ph
提交时间：2021-10-05