细胞群体中接触抑制的最优量化

摘要:接触抑制是指在高细胞密度区域细胞迁移和/或细胞增殖速率降低。在正常条件下,接触抑制与正常组织的正常功能相关,而接触抑制的异常调节与病理条件(如肿瘤扩散)相关。不幸的是,标准的数学建模方法通过缩放参数隐藏了控制接触抑制的重要性。此外,标准的实验方案无法量化接触抑制的效应,因为它们仅关注早期时段、低密度动力学的数据。在这里,我们使用逻辑增长方程作为接触抑制的夸张性模型,提出了如何最好地减轻这些问题的建议。采用贝叶斯方法,我们量化了实验设计不同特征之间的权衡以及参数不确定性的估计,以便我们能够重新制定标准细胞增殖测定法,提供低密度内在增长率$lambda$和载体密度$K$(即接触抑制的一个衡量指标)的估计。

作者:David J. Warne (1), Ruth E. Baker (2), Matthew J. Simpson (1) ((1) Queensland University of Technology, (2) University of Oxford)

论文ID:1709.05059

分类:Cell Behavior

分类简称:q-bio.CB

提交时间:2018-03-01

PDF 下载: 英文版 中文版pdf翻译中