毛细管中的全基因组扩增中的MDA
摘要：在高通量测序的低输入模板样本制备中，全基因组扩增（WGA）起着重要作用。多位点扩增（MDA）是一种流行的等温WGA方法，但存在极不均匀的扩增问题。过去的优化方法是将试剂分离到微流控设备中的许多微小腔室或液滴中，从而显著改善了MDA的扩增均一性。然而，生物研究者仍然存在处理芯片制造和液滴操作的技术难关。在这里，我们提出了一种新型的MDA协议，即管内MDA（icMDA），通过将试剂分散在一根长的准1D毛细管中，显著简化了操作，并改善了扩增的均一性。我们证明icMDA能够更高效、更敏感地准确检测SNV。此外，该简便的方法既不需要定制仪器，也不需要复杂操作，使其成为大多数实验室可即用的方法。
作者：Junji Li, Na Lu, Xulian Shi, Yi Qiao, Liang Chen, Mengqin Duan, Yong Hou, Qinyu Ge, Yuhan Tao, Jing Tu, Zuhong Lu
论文ID：1705.10647
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2019-02-12