胚胎干细胞中远程增强子在塑造三维折叠模式和定义人类特有的间期染色质架构特征中的作用
摘要：人类特异性基因组调控网络（GRNs）中对人类特有性状发展的分子和遗传定义仍然是一个非常重要的挑战。对人类特异性基因组调控位点（HSGRL）进行全基因组接近放置分析，发现了丰富了HSGRL的拓扑关联域（TADs），并将其指定为人类进化中迅速演化的TADs（Genome Biol Evol. 2016 8; 2774-88）。这里，进行了HSGRL、hESC丰富的增强子、超增强子（SEs）和特定的子TAD结构（称为超增强子域）的分析。与小鼠相比，间期染色质的主要调控结构在hESC基因组中进化出明显不同的特征：超增强子数量增加了3倍，中位超增强子大小显著增大。同时，hESC基因组中总的TAD数量增加了42\%，而中位TAD大小显著减小（p=9.11E-37）。目前的分析揭示了HSGRL在塑造间期染色质组织和功能中人类特异性特征方面的可能全局作用，这是通过在定义的基因组坐标上加速创建与HSGRL有关的新增强子来实现的。hESC基因组中TAD和超增强子域的间期染色质结构收敛趋势可能反映了线性染色质纤维的3D折叠模式的变化，旨在通过创建主要由一个基因调控域结构来增强调控复杂性和功能精确性。
作者：Gennadi Glinsky
论文ID：1705.09614
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2017-05-29