比较转录组中从统计显著差异表达基因中获取具有生物学意义的基因的富集方法

摘要:细胞协同调整基因组表达以适应其环境的变化。在体外临床前测试中,培养基中的药物有时会导致基因组表达系统的剧烈转变,这取决于浓度。例如,暴露于高浓度苯巴比妥酸盐(>0.25 mM)的原代培养细胞恢复其组织特异性特征,作为一个个体有机体的一部分。转录组的剧变中断了在比较转录组学中发现具有生物学意义的基因。在这里,我们使用苯巴比妥酸盐和中国仓鼠卵巢衍生的CHO-K1细胞系,比较了环境变化的量和转录组变化的量;在体外临床前测试中,允许使用免疫细胞系,然后是原代培养细胞。

作者:Panpaki Seekaki and Norichika Ogata

论文ID:1705.03201

分类:Cell Behavior

分类简称:q-bio.CB

提交时间:2017-05-16

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