通过信号调控转录：变构诱导的预测理论
摘要：调控在生命的所有领域中都普遍存在，但我们仍然缺乏将实验可调参数直接链接到系统的输入-输出响应的简单且预测性的理论。为此，我们提出了一种使用Monod-Wyman-Changeux模型的调控转录的通用理论。我们通过首先预测跨越大范围的抑制子拷贝数和DNA结合强度的菌株的行为，然后构建和测量它们的响应来严格测试这个模型在细菌中的广泛使用的简单抑制模式。我们的模型不仅准确地捕捉到这些菌株的诱导曲线，还能够导出关键属性（如动态范围和\[ EC\_{50}\]）的解析表达式。最后，我们推导出一种离子调控抑制剂的自由能表达式，使我们能够将我们的实验数据折叠成一个能够捕捉诱导曲线多样现象的单个主曲线。
作者：Manuel Razo-Mejia, Stephanie L. Barnes, Nathan M. Belliveau, Griffin Chure, Tal Einav, Mitchell Lewis, Rob Phillips
论文ID：1702.07460
分类：Subcellular Processes
分类简称：q-bio.SC
提交时间：2017-06-23