药物-受体相互作用中的统计热力学基础:双重湮灭和双重解耦的变化理论,重新审视

摘要:炼金术理论在分子动力学模拟药物发现项目中正逐渐成为一种有前途的工具。在本理论贡献中,我重新审视了药物-受体系统中非共价相互作用的统计力学基础,提供了一种统一的处理方法,涵盖了炼金术方法中最重要的变体,从Jorgensen和Ravimohan的经典『双消失法』(W.L. Jorgensen和C. Ravimohan,J. Chem. Phys. 83,3050, 1985),到Gilson的『双解耦法』(M. K. Gilson 和 J. A. Given 和 B. L. Bush和J. A. McCammon,Biophys. J. 72, 1047 1997),以及Deng和Roux的炼金术理论(Y. Deng 和 B. Roux,J. Chem. Theory Comput., 2, 1255 2006)。突出和讨论了各种炼金术方法之间的联系和差异,并最终将其置于非平衡热力学的更广泛背景中。

作者:Piero Procacci

论文ID:1607.03783

分类:Biomolecules

分类简称:q-bio.BM

提交时间:2020-02-25

PDF 下载: 英文版 中文版pdf翻译中