生物化学网络中的动态取样和信息编码

摘要:细胞利用生物化学网络将环境信息转化为细胞内反应。这些反应可能会非常动态,但是信息如何编码在这些动态中仍然不清楚。在本研究中,我们使用信息理论中的矢量或多时点测量来研究成纤维细胞细胞对ATP诱导的钙反应中的信息动态编码。我们发现提取的信息量取决于生理约束,例如采样率和下游网络的内存容量,并且受到内在噪声和外在噪声的不同影响。通过与一个最简物理模型进行比较,我们发现令人惊讶的是,信息通常对底层动态的详细结构不敏感,而解码机制则作为一个简单的低通滤波器。这些结果证明了细胞中动态信息存储的机制和限制。

作者:Garrett D. Potter and Tommy A. Byrd and Andrew Mugler and Bo Sun

论文ID:1607.01841

分类:Cell Behavior

分类简称:q-bio.CB

提交时间:2017-04-05

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