SMISS:通过整合多个来源进行蛋白质功能预测的服务器
摘要:SMISS是一种用于蛋白质功能预测的新型网络服务器。可以选择不同的预测器来满足不同的需求。它集成了不同的来源以提高蛋白质功能预测的准确性,包括查询蛋白质序列、蛋白质相互作用网络、基因相互作用网络以及从蛋白质功能关联中挖掘的规则。当数据库中没有同源物时,SMISS会自动切换到基于查询序列的从头预测蛋白质功能。它以fasta格式的序列作为输入,多个序列可以一起提交而不会对计算速度产生太大影响。PHP和Perl是服务器中主要使用的编程语言。使用CodeIgniter MVC PHP Web框架和Bootstrap前端框架构建服务器。它可以在标准的Web浏览器上在不同的平台上使用,如Windows、Mac OS X、Linux和iOS。我们的网站不需要任何插件。可用性:http://tulip.rnet.missouri.edu/profunc/.
作者:Renzhi Cao, Zhaolong Zhong, Jianlin Cheng
论文ID:1607.01384
分类:Genomics
分类简称:q-bio.GN
提交时间:2016-07-06