mRNA翻译的最佳下调
摘要：mRNA翻译的下调节在各种生物医学领域中是一个重要问题，从开发针对肿瘤和病毒性疾病的有效药物到开发可用于疫苗接种的削弱病毒株。在这里，我们使用一个数学模型称为核糖体流动模型(RFM)来研究mRNA翻译的下调节问题。在RFM中，mRNA分子被建模为一个由$n$个位点组成的链。相邻位点之间的核糖体流动由$n+1$个转移速率调控。给定一组可行的转移速率，来模拟所有可能突变的结果，我们考虑通过改变该可行速率集合内的速率来最大限度地下调节翻译速率的问题。在可行集合的某些条件下，我们证明了最优解可以高效确定。我们还严格分析了下调节优化问题的两种特殊情况。我们的结果表明，人们必须关注核糖体流动速率对蛋白质产量速率产生最强影响的mRNA分子内的位置。然而，这个速率不一定是mRNA分子上最慢的转移速率。我们讨论了这些结果的一些生物学意义。
作者：Yoram Zarai and Michael Margaliot and Tamir Tuller
论文ID：1606.08094
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2016-06-29