四元数表示的遗传密码中的手性
摘要：一种基因密码的四元数表示法被更新以包括核苷酸碱基和氨基酸的手性。该原始表示法将每个核苷酸碱基分配给一个模为7的质数整数四元数，并涉及一个函数，将由这些四元数表示的三联密码与另一个整数四元数（氨基酸型四元数）相关联，以保留标准基因密码的基本特征（尤其是其退化特征）。为了展示这种四元数表示法的优势，我们除了根据蛋白质中的类型四元数将每个氨基酸与一个实数四元数相关联之外，还根据其在蛋白质中的顺序（顺序四元数），并设计了一个算法，通过使用类型和顺序四元数从一级结构到三级结构的蛋白质。在这个背景下，我们通过观察到模为7的八个整数四元数集可以划分为两个基数为四的子集，其中它们的元素彼此共轭，并将它们一一对应地与腺嘌呤、胞嘧啶、鸟嘌呤和尿嘧啶的两个对映体（D和L）的两个集合。因此，根据代码演变提出的两个图表的指导，我们定义了在每种情况下将L-（D-）氨基酸型整数四元数分配给D-（L-）碱基三联体的函数。该分配是这样的，对于给定的D-氨基酸，相应的整数四元数是对应于对映体L的共轭。对于氨基酸获得的手性类型四元数，与一组常见的顺序四元数一起被用来描述L类和D类的同手性蛋白质的折叠。
作者：C. Manuel Carlevaro, Ramiro M. Irastorza and Fernando Vericat
论文ID：1602.05847
分类：Other Quantitative Biology
分类简称：q-bio.OT
提交时间：2016-02-19