蛋白质氨基酸突变表中隐藏的热力学信息

摘要:结合标准的1992年20x20替代矩阵(基于块对齐的BLOSUM62),与标准的1982年氨基酸疏水性尺度KD和现代的2007年疏水性尺度MZ,并比较结果。20参数的KD和MZ疏水性尺度在热力学特性上有所不同,对应于一阶和二阶相变。KD和MZ的比较结果表明,突变率反映了定量迭代的定性氨基酸疏水和亲水的二进制2x10特性,这些特性定义了四元4x5个亚群(而不是五元5x4个亚群),现代MZ生物信息尺度给出了更好的结果。四元5子串MZ 4x5亚群被称为突变子(Mu5)。

作者:V. Sachdeva and J. C. Phillips

论文ID:1601.03037

分类:Other Quantitative Biology

分类简称:q-bio.OT

提交时间:2016-01-14

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