大规模多组学微生物组数据库(M3DB):面向微生物组数据集的可扩展数据仓库与分析平台

摘要:大规模多组学微生物组数据库(M3DB)是一个数据仓库和分析解决方案,旨在处理使用NGS技术在典型微生物组项目中获得的多样、复杂且前所未有的序列和分类数据。M3DB是一个基于Apache Hadoop、Apache Hive和PostgreSQL技术开发的平台。它使用户能够存储、分析和管理大量数据,并以快速高效的方式查询数据。M3DB框架包括命令行工具来处理和存储微生物组数据,以及一个易于使用的Web界面,用于上传、查询、分析和可视化数据和/或结果。可用性:M3DB的源代码可在http://www.github.com/nisheth/M3DB上免费下载。

作者:Shaun W. Norris, Steven P. Bradley, Hardik I. Parikh and Nihar U. Sheth

论文ID:1512.03674

分类:Other Quantitative Biology

分类简称:q-bio.OT

提交时间:2015-12-14

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